Protein–RNA interactions for Protein: A2BHN9

4931422A03Rik, RIKEN cDNA 4931422A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931422A03RikA2BHN9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931422A03RikA2BHN9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931422A03RikA2BHN9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931422A03RikA2BHN9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms