Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn3aA2ASI5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn3aA2ASI5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn3aA2ASI5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn3aA2ASI5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms