Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cavin4A2AMM0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cavin4A2AMM0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cavin4A2AMM0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cavin4A2AMM0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cavin4A2AMM0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cavin4A2AMM0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cavin4A2AMM0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cavin4A2AMM0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cavin4A2AMM0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cavin4A2AMM0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cavin4A2AMM0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cavin4A2AMM0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cavin4A2AMM0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms