Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn3A2ALK8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn3A2ALK8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn3A2ALK8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms