Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Calcoco2A2A6M5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calcoco2A2A6M5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calcoco2A2A6M5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calcoco2A2A6M5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms