Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc173A0JLY1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc173A0JLY1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc173A0JLY1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms