Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930469K13RikA0A286YDB2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930469K13RikA0A286YDB2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930469K13RikA0A286YDB2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930469K13RikA0A286YDB2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms