Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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