Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ99

Gm29666, Predicted gene 29666, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29666A0A087WQ99 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29666A0A087WQ99 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm29666A0A087WQ99 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29666A0A087WQ99 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms