Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

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Length 1,202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC034090A0A087WP46 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC034090A0A087WP46 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BC034090A0A087WP46 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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