Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms