Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slit2Q9R1B9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms