Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vav3Q9R0C8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms