Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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