Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnip3Q9QXT8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnip3Q9QXT8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnip3Q9QXT8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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