Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Higd1aQ9JLR9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Higd1aQ9JLR9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Higd1aQ9JLR9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1aQ9JLR9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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