Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms