Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FancaQ9JL70 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FancaQ9JL70 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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FancaQ9JL70 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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FancaQ9JL70 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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FancaQ9JL70 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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FancaQ9JL70 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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FancaQ9JL70 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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FancaQ9JL70 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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FancaQ9JL70 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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FancaQ9JL70 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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FancaQ9JL70 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FancaQ9JL70 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms