Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms