Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tpcn1Q9EQJ0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tpcn1Q9EQJ0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tpcn1Q9EQJ0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tpcn1Q9EQJ0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Tpcn1Q9EQJ0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Tpcn1Q9EQJ0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Tpcn1Q9EQJ0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpcn1Q9EQJ0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tpcn1Q9EQJ0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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