Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp13a1Q9EPE9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp13a1Q9EPE9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms