Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syvn1Q9DBY1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syvn1Q9DBY1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms