Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms