Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Capn9Q9D805 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn9Q9D805 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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