Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubb4aQ9D6F9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms