Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabl3Q9D4V7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms