Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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