Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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RpainQ9CWY9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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