Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CWU4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CWU4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms