Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms