Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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Chmp3Q9CQ10 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms