Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms