Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trps1Q925H1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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