Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms