Protein–RNA interactions for Protein: Q920R6

Atp6v0a4, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 4, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0a4Q920R6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atp6v0a4Q920R6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atp6v0a4Q920R6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atp6v0a4Q920R6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atp6v0a4Q920R6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atp6v0a4Q920R6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atp6v0a4Q920R6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atp6v0a4Q920R6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atp6v0a4Q920R6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atp6v0a4Q920R6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v0a4Q920R6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6v0a4Q920R6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6v0a4Q920R6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6v0a4Q920R6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6v0a4Q920R6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Atp6v0a4Q920R6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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