Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Afg3l1Q920A7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Afg3l1Q920A7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Afg3l1Q920A7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Afg3l1Q920A7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Afg3l1Q920A7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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