Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc12Q8R344 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms