Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r200Q8R281 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Vmn1r200Q8R281 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Vmn1r200Q8R281 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Vmn1r200Q8R281 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Vmn1r200Q8R281 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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