Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms