Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atxn7l2Q8C8K6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atxn7l2Q8C8K6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms