Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccser1Q8C0C4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms