Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Snx16Q8C080 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Snx16Q8C080 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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Snx16Q8C080 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Snx16Q8C080 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Snx16Q8C080 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Snx16Q8C080 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Snx16Q8C080 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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