Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms