Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Rnf187Q8BFX1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf187Q8BFX1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf187Q8BFX1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf187Q8BFX1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf187Q8BFX1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf187Q8BFX1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf187Q8BFX1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf187Q8BFX1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf187Q8BFX1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf187Q8BFX1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf187Q8BFX1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf187Q8BFX1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf187Q8BFX1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf187Q8BFX1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf187Q8BFX1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf187Q8BFX1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf187Q8BFX1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rnf187Q8BFX1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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