Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim65Q8BFW4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim65Q8BFW4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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