Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms