Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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