Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdp1Q7TSG2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms