Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp397Q7TNK4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms