Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nphp3Q7TNH6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms